小麥磨面機成套設備的分離系統主要安裝在主軸的上方，集刀片切割和高速氣流的沖擊、碰撞雙重粉碎功能于一體，能同時完成微粒分選和加工。

小麥磨面機成套設備分離系統的操作流程：

1、打開門蓋，將選定的轉子輕輕放到電機軸上，擰上螺釘使轉子與電機軸緊緊連接在一起(注意動作應小心輕柔，避免大幅度左右搖晃和上下拉壓，以免損壞電機柔性支承)，完畢用手輕輕旋轉一下轉子體，應轉動靈活。

2、將離心管放入轉子試管孔內,各離心管必 須等重量對稱放入，以確保儀器平衡運行，然后關上門蓋并檢查門蓋是否確已鎖好(關上后輕輕用力掀門蓋，門蓋掀不開)，接通電源，按下電源開關，設置轉速、時間等運行參數。

分離系統是利用離心沉降原理，使原料中密度不同的細胞(粒子)在離心力的作用下實現分離、濃縮或提純的，設備啟動后，電機帶動轉子高速旋轉所產生的相對離心力(RCF)使密度不同的細胞(粒子)分離，相對離心力的大小取決于試樣所處的位置至軸心的水平距離。

要想保障小麥磨面機成套設備產品的質量，就需要對于不同的物料進行篩選，采取相應的分離系統，分離系統由彈簧、彈簧墊、內磨頭、調整螺母和外磨頭組成，在切割粉碎過程中，轉子會產生高速氣流，這些高速氣流會隨刀片切割方向旋轉，物料在氣流中加速，因此被反復沖擊并粉碎。